لقد استفادت جامعة الوادي بخمسة (05) مخابر مخصصة لمعهد العلوم والتكنولوجيا هي :

مخــابرالفيزياء:

* مخبر الميكانيك

* مخبر الكهرباء والمغناطيسية

* مخبر البصريات

* مخبر الترموديناميك

* مخبر الفيزياء الذرية

* مخبر الفيزياء النووية

* مخبر الاهتزازات والامواج

* مخبر فيزياء الجسم الصلب

مخــابرالكيمياء:

* مخبر التحليل والقياس

* وسائل المخبر

مخــابر هندسة الطرائق:

* مخبر التحويلات

* مخبر الحركة والترموديناميك

* مخبر الهندسة الكيميائية