يترأسه رئيس الجامعة, وهو يتألف من نواب رئيس الجامعة, عمداء الكليات, رؤساء المجالس العلمية للكليات, والأعضاء المنتخبين من طرف الكليات والأساتذة.

 يقدم المجلس العلمي للجامعة آراء و توصيات بخصوص :

• المخططات السنوية ومتعددة السنوات للتدريب والبحوث الجامعية,
• مشاريع إنشاء أو تعديل أو حل الكليات,المعاهد, الأقسام و عند اﻹقتضاء, الملحقات, وحدات البحث و مخابر البحث,
• برامج التبادل والتعاون العلمي الوطنية والدولية,
• حصيلة التكوين والبحث العلمي في الجامعة,
• برامج تعاون الجامعة مع مختلف القطاعات الإجتماعية و الإقتصادية,
• برامج الأحداث العلمية الجامعية,
• تدابير لاستغلال نتائج الأبحاث,
• ميزانيات ومشاريع اقتناء الوثائق العلمية والتقنية.

ويقترح توجيهات لسياسات البحوث والمؤلفات العلمية والتقنية للجامعة.
كما يعطي المجلس رأيه حول كل المسائل ذات البعد البيداغوجي و العلمي والتي تسند إليه من قبل رئيسه.

ويقوم رئيس الجامعة بإبلاغ مجلس الإدارة باﻵراء و التوصيات الصادرة عن المجلس العلمي للجامعة.

يعقد المجلس العلمي للجامعة إجتماعين خلال السنة في دورات عادية.
وقد يجتمع المجلي في دورة غير عادية, بناءا على إستدعاء إما من الوزير المكلف بالتعليم العالي, أو رئيس المجلس, أو على طلب من ثلثي أعضاء المجلس.

يتكون المجلس العلمي من :

• رئيس الجامعة,
• نواب الرئيس,
• عمداء الكليات,
• رؤساء المجالس العلمية للكليات,
• مسؤول المكتبة المركزية للجامعة,
• ممثلين للأساتذة عن كل كلية منتخبين من بين الأساتذة الذين ينتمون إلي أعلى درجة,
• ممثلين منتخبين من هيئة اﻷساتذة,
• شخصيتين خارجيتين , هما أساتذة في جامعات أخرى .

ويمكن للمجلس دعوة أي أشخاص يمكن أن تكون كفاءتهم مفيدة لعمل المجلس.